1.3.32 atpdesign.sh

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1.3.32 atpdesign.sh

単純金属の表面、カーボンナノチューブ(CNT) 、カーボンナノリボン、クラスター等の原子配置を作成する。電子系の収束を行う前に実行し、スクリプトsample.dat.sh内の原子配置データをあらかじめ計算するものである。atpdesign0.shが子プロセスとして動く。作る系に応じて、入力の指定が異なるので、スクリプト内のサンプル行をatpdesign0.shの前に移動させて、編集し、exlist.sh にatpdesign.shを指定して使用する。入力データの指定は、キーワード(keyword)の入力後、それに応じたデータを指定する。

表面系を作成する場合、

: keyword
surfaceを指定する。
: element
化学記号を指定する。
: crystaltype
金属の結晶構造を指定する。現在は、fccの(111)(001)(110)表面、 diamondの(111)表面しか準備されていない。
: millerindex
表面のミラー指数を指定する。
: numberoflayer
層の個数を指定する。
: numberofvacuumlayer
真空層の個数を指定する。
: crystallatticeconstant
結晶の格子定数を指定する。

CNTを作成する場合、

: keyword
cntを指定する。
: chiralindexn,chiralindexm
カイラル指数を指定する。
: numberofcell
チューブ軸方向の単位胞の数を指定する。

$\sigma$ ボンド( $sp^{2}$ 混成軌道)を水素終端したカーボンナノリボンを作成する場合、

: keyword
c-ribbonを指定する。
: edge
エッジの種類 armchairまたはzigzagを指定する。
: numberofcolumn
リボンの太さ方向のカーボン列の数を指定する。
: numberofcell
リボンの長さ方向の単位胞の数を指定する。炭素原子数は、 armchair、zigzagのいずれの場合も 2 $\times$ (numberofcolumn) $\times$ (numberofcell)個であり、水素原子数は、armchairのとき、4 $\times$ (numberofcell)個、 zigzagのとき、2 $\times$ (numberofcell)個である。

クラスターを作成する場合は、まだ使用できない。

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