1.3.23 ex_opts.sh

The optimization of the atomic structure based on the Car-Parrinello moleclar dynamics method is executed by using the converged electron system. The substantial execution is performed by opts.sh. If you set this script to execute after finishing ex_opte.sh normally, you can execute this script without in-depth knowledge of the initial configuration. This script behaves differently in the first and second exectution. In the first execution, for the calculation code cpvos.x or cpvop.x, the calculation is started by NBEG=-1. After the second execution, it started by NBEG=1.

収束した電子系からカー$\cdot$パリネロ法の分子動力学を用いて、原子構造の 最適化を行なう。実質的な実行は、opts.shが行なっている。 ex_opte.shを正常に終了した後に、このスクリプトを計算するように すると詳細な初期設定の知識がなくともこのスクリプトを起動することが できる。 このスクリプトは、初回の起動と2回目の起動の動作が異なっている。初回は、 cpvos.xまたはcpvop.xの計算コードに対して、 NBEG=-1で計算を開始し、2回目からは、NBEG=1で開始する。

jnumstart, jnumend
In jnumstart, you must assign the triple-digit natural number. In jnumend, you must assign the triple-digit natural number which is larger than jnumstart. The initial job number is allocated to jnumstart, and the job number is incremented each time to calculate this script file. When the allocated job number becomes jnumend, it finishes without calculating. If you want to proceed further with the calculation, you should assign more larger natural number to jnumend and execute the script file.

jnumstartには、3桁の自然数を指定する。 jnumendには、jnumstartよりも大きい3桁の自然数を 指定する。初回のジョブ番号にjnumstartが割り付けられ、 このスクリプトを計算する毎にジョブ番号が大きくなってゆく。 割り付けられるジョブ番号がjnumendになると、計算を 行なわずに、終了する。さらに計算を進めるときは、jnumendに さらに大きな自然数を指定して、スクリプトを計算すればよい。

nomore0
The number of steps of Car-Parrinello molecular dynamic method which is calculated in the time is assigned. Even if the number of steps differ from every number of times, it operates satisfactory.

その回に計算するカー$\cdot$パリネロ法の分子動力学ステップの回数を 指定する。回数毎にステップ数が異なっていても問題なく動作する。

In case of redoing the calculation from first or executing new calculation, if you should remove the file jobs which exists in ${rundir}, it will be regards as the first-time calculation.

初回から計算をやり直すまたは新しい計算を行なう場合は、ディレクトリー ${rundir}に存在するファイルjobsを消去すれば、初回の計算とみなされる。